بیشترین و مهمترین عوارض بعد از عمل جراحی هموروئید و یا عمل بواسیر در روش هایی مانند هموروئیدکتومی که یکی از انواع روش های جراحی می باشد شامل موارد زیر است:

• درد و خونریزی[*]عفونت ادراری[*]بی اختیاری در دفع[*]تنگی کانال مقعد[*]فیستول مقعد و یا عود بواسیر[*]احتباس ادراری[*]پرولاپس رکتوم

به جز مواردی که در بالا ذکر شد عوارض ناشی از تزریق داروی بیهوشی هم به عوارض جراحی هموروئید اضافه می شود چون طی درمان بواسیر از طریق جراحی بیمار با داروی بیهوشی بیهوش می شود و نیاز به بستری شدن دارد. با توجه به تمام این مشکلات ممکن است نتیجه مطلوبی بعد از درمان حاصل نشود و بیماری مجددا عود کند، و یا اینکه عوارض عمل بواسیر که در بالا ذکر شد گریبان بیمار را بگیرد.
عوارض لیزر بواسیر

با توجه به سرپایی بودن درمان بواسیر با لیزر که در مطب بدون نیاز به بیهوشی و بستری شدن انجام می شود، و فرد در کمتر از نیم ساعت می تواند به کارهای روزمره خود برسد و هم چنین عوارض بی شمار جراحی بواسیر هنوز هم درمان قطعی و تضمینی برای این بیماری لیزر می باشد که می توان گفت درمان با لیزر تقریبا بدون عوارض می باشد، جز در مواردی که لیزر پر توان و یا دستگاه های قدیمی لیزر استفاده شود احتمال سوزاندن بافت ها وجود دارد ولی در دستگاه های جدید و پیشرفته امروزی این احتمال بسیار کم است و با قطعیت می توان گفت تنها روش درمانی بدون عوارض جانبی برای هموروئید، درمان از طریق لیزر می باشد که به جز اینکه بیمار درد و خونریزی کمتری دارد در این روش در وقت و هزینه ی او هم صرفه جویی می شود.